Oligo sintetizadorearen printzipioa
Biologia molekularraren eta genetikaren ikerketaren alorretan, DNA sintetizatzeko gaitasunak berebiziko garrantzia du.DNAren sintesiak DNA molekulen ekoizpen artifiziala dakar nukleotidoak ordena zehatz batean antolatuz.Hori lortzeko, zientzialariek oligonukleotidoen sintetizatzaile gisa ezagutzen den tresna indartsu batean oinarritzen dira, DNA sintetizatzaile gisa ere ezagutzen dena.
Oligonukleotidoen sintetizagailu bat oligonukleotido izeneko DNA molekula laburrak automatikoki sintetizatzen dituen tresna sofistikatua da.DNAren kate labur hauek 10 eta 100 nukleotido arteko luzera izan ohi dute eta ezinbestekoak dira hainbat aplikaziotan, besteak beste, polimerasaren kate-erreakzioa (PCR), gene-sintesia, ingeniaritza genetikoa eta DNAren sekuentziazioa.
Oligonukleotidoen sintetizatzaileek izenez ezagutzen den teknika baten printzipioan funtzionatzen dutefase solidoko sintesia.Metodo hau Marvin Caruthers doktore Nobel saridunak aitzindari izan zuen 1970eko hamarkadan eta urteen poderioz findu egin da DNA sekuentzien sintesia hobetzeko.Oligonukleotidoen sintesia hazten den katearen 5'-muturrean nukleotido-hondarrak urratsez urrats gehituz egiten da nahi den sekuentzia muntatu arte.Gehitze bakoitza sintesi-ziklo gisa deitzen da eta lau erreakzio kimikoz osatuta dago:
1. urratsa: desblokeatzea (detritilazioa) ----------2. urratsa: Akoplazioa ---------3. urratsa: muga------------4. urratsa: oxidazioa
Prozesu hau nukleotido bakoitzeko errepikatzen da nahi den sekuentzia lortu arte.Oligonukleotido luzeagoetarako, baliteke ziklo hau hainbat aldiz errepikatu behar izatea sekuentzia osoa sintetizatzeko. Sintesi-zikloaren urrats bakoitza zehatz-mehatz kontrolatzeko gaitasuna funtsezkoa da oligonukleotidoen sintetizatzaile batentzat.Erabilitako erreaktiboek, hala nola nukleotidoek eta aktibatzaileek, kalitate handikoak izan behar dute sintesi zehatza eta eraginkorra bermatzeko.Horrez gain, sintetizatzaileek zehaztasun handiko tenperatura kontrola eta beste ingurumen-baldintza batzuk behar dituzte nahi diren akoplamendu-erreakzioak sustatzeko eta nahi ez diren erreakzioak saihesteko.
Oligonukleotido bat guztiz sintetizatuta dagoenean, normalean euskarri solidotik zatitu eta araztu egiten da gainerako babes-taldeak edo ezpurutasunak kentzeko.Ondoren, araztutako oligonukleotidoak beheranzko aplikazioetarako prest daude.
Teknologiaren aurrerapenei esker, aldi berean ehunka edo milaka oligonukleotido sintetizatzeko gai diren errendimendu handiko oligonukleotido sintetizatzaileak garatzea ahalbidetu dute.Tresna hauek mikroarrayetan oinarritutako sintesi teknologia erabiltzen dute, ikertzaileek oligonukleotidoen liburutegi handiak azkar sortzeko aukera ematen diete ikerketa-helburu ezberdinetarako.
Laburbilduz, oligonukleotidoen sintetizatzaileen atzean dauden printzipioak fase solidoko sintesi tekniken inguruan oinarritzen dira, euskarri solido batean nukleotidoak urratsez urrats gehitzea dakarte.Sintesi-zikloaren kontrol zehatza eta kalitate handiko erreaktiboak ezinbestekoak dira sintesi zehatza eta eraginkorra izateko.Oligo sintetizatzaileek funtsezko zeregina dute DNAren ikerketan, zientzialariei oligonukleotido pertsonalizatuak sortzeko aukera ematen diete hainbat aplikaziotarako, bioteknologiaren eta ikerketa genetikoaren aurrerapenei lagunduz.
Argitalpenaren ordua: 2023-01-01